御坊堂的淵源由來已久，清朝咸豐年間，有一位姓黃的宮廷御醫?窮其精力煉制成一種以海狗腎為主要原料補腎健體，延年益壽的丹丸，取名“海狗丸”。良好的效果深受宮廷顯貴珍愛，其配方也就成為黃氏家族的歷代不傳秘方。后來，黃御醫告老還鄉，在南方老家開了一家藥號“草坊堂”，皇上知道后，念及黃老先生對宮廷所作的貢獻，故賜堂號為“御坊堂”。當時也在民間流傳著這樣一句話：北有同仁堂，南有御坊堂。